Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01787 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01787 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01787 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01787 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01787 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01787 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01787 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01787 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01787 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01787 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01787 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01787 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01787 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01787 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01787 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01787 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01787 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01787 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01787 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01787 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01787 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01787 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01787 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01787 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01787 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01787 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01787 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01787 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01787 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01787 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01787 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01787 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01787 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01787 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01787 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01787 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01787 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01787 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01787 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01787 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01787 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01787 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01787 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01787 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01787 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01787 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01787 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01787 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01787 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01787 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01787 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01787 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01787 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01787 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01787 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01787 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01787 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01787 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01787 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01787 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01787 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01787 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01787 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01787 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01787 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01787 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01787 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01787 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01787 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01787 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01787 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01787 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01787 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01787 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01787 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01787 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01787 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01787 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01787 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01787 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01787 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01787 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01787 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01787 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01787 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01787 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01787 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01787 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01787 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01787 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01787 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01787 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01787 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01787 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01787 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01787 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01787 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01787 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01787 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms