Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sypl2O89104 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sypl2O89104 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms