Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dnmt3aO88508 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms