Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc4a4O88343 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc4a4O88343 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.9 ms