Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Vamp4O70480 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vamp4O70480 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms