Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lnx1O70263 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Lnx1O70263 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lnx1O70263 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms