Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
StrnO55106 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
StrnO55106 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
StrnO55106 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
StrnO55106 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
StrnO55106 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
StrnO55106 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
StrnO55106 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
StrnO55106 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
StrnO55106 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
StrnO55106 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
StrnO55106 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
StrnO55106 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
StrnO55106 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
StrnO55106 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
StrnO55106 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
StrnO55106 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
StrnO55106 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
StrnO55106 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
StrnO55106 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
StrnO55106 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
StrnO55106 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
StrnO55106 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
StrnO55106 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
StrnO55106 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
StrnO55106 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
StrnO55106 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
StrnO55106 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
StrnO55106 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
StrnO55106 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
StrnO55106 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
StrnO55106 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
StrnO55106 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
StrnO55106 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
StrnO55106 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
StrnO55106 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
StrnO55106 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
StrnO55106 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
StrnO55106 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
StrnO55106 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
StrnO55106 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
StrnO55106 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
StrnO55106 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
StrnO55106 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
StrnO55106 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
StrnO55106 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
StrnO55106 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
StrnO55106 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
StrnO55106 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
StrnO55106 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
StrnO55106 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
StrnO55106 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
StrnO55106 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
StrnO55106 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
StrnO55106 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
StrnO55106 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
StrnO55106 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
StrnO55106 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
StrnO55106 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
StrnO55106 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
StrnO55106 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
StrnO55106 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
StrnO55106 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
StrnO55106 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
StrnO55106 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
StrnO55106 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
StrnO55106 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
StrnO55106 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
StrnO55106 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
StrnO55106 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
StrnO55106 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
StrnO55106 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
StrnO55106 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
StrnO55106 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
StrnO55106 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
StrnO55106 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
StrnO55106 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
StrnO55106 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
StrnO55106 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
StrnO55106 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
StrnO55106 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
StrnO55106 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
StrnO55106 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
StrnO55106 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
StrnO55106 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
StrnO55106 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
StrnO55106 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
StrnO55106 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
StrnO55106 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
StrnO55106 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
StrnO55106 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
StrnO55106 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
StrnO55106 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
StrnO55106 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
StrnO55106 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
StrnO55106 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
StrnO55106 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
StrnO55106 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
StrnO55106 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
StrnO55106 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms