Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tpd52l1O54818 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpd52l1O54818 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms