Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1baO35930 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1baO35930 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1baO35930 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1baO35930 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1baO35930 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1baO35930 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1baO35930 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gp1baO35930 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gp1baO35930 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gp1baO35930 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gp1baO35930 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gp1baO35930 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gp1baO35930 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gp1baO35930 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gp1baO35930 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gp1baO35930 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gp1baO35930 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms