Protein–RNA interactions for Protein: O35242

Nsmaf, Protein FAN, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmafO35242 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NsmafO35242 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NsmafO35242 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NsmafO35242 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NsmafO35242 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NsmafO35242 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NsmafO35242 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NsmafO35242 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NsmafO35242 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms