Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtgisO35074 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtgisO35074 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtgisO35074 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtgisO35074 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtgisO35074 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtgisO35074 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtgisO35074 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtgisO35074 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtgisO35074 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtgisO35074 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtgisO35074 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtgisO35074 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtgisO35074 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtgisO35074 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtgisO35074 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtgisO35074 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtgisO35074 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtgisO35074 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtgisO35074 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtgisO35074 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtgisO35074 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms