Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hdac1O09106 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdac1O09106 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac1O09106 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms