Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms