Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bbip1J3QMK2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms