Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem200cJ3QK46 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem200cJ3QK46 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms