Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pabpc4lG5E8X2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pabpc4lG5E8X2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms