Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r67G5E8C1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r67G5E8C1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms