Protein–RNA interactions for Protein: F6ZZG8

Gm5624, Predicted gene 5624 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5624F6ZZG8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5624F6ZZG8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5624F6ZZG8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 269.4 ms