Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8247F6VRJ8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm8247F6VRJ8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms