Protein–RNA interactions for Protein: F6QL70

Gm17669, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17669F6QL70 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Gm17669F6QL70 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17669F6QL70 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17669F6QL70 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17669F6QL70 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17669F6QL70 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17669F6QL70 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Gm17669F6QL70 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Gm17669F6QL70 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Gm17669F6QL70 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17669F6QL70 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Gm17669F6QL70 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17669F6QL70 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Gm17669F6QL70 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17669F6QL70 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Gm17669F6QL70 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gm17669F6QL70 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17669F6QL70 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gm17669F6QL70 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gm17669F6QL70 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gm17669F6QL70 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17669F6QL70 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17669F6QL70 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17669F6QL70 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17669F6QL70 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17669F6QL70 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17669F6QL70 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17669F6QL70 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17669F6QL70 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17669F6QL70 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17669F6QL70 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17669F6QL70 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17669F6QL70 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms