Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp17lbE9Q9U0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp17lbE9Q9U0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp17lbE9Q9U0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp17lbE9Q9U0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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