Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh18E9Q9Q6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms