Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
2610021A01RikE9Q0Q3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms