Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Trappc8E9PWG2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Trappc8E9PWG2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Trappc8E9PWG2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms