Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc144bE9PVZ3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc144bE9PVZ3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms