Protein–RNA interactions for Protein: E9PUT9

Gm3252, Predicted gene 3252, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3252E9PUT9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3252E9PUT9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3252E9PUT9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3252E9PUT9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3252E9PUT9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3252E9PUT9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms