Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L6

Slc18b1, MFS-type transporter SLC18B1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18b1D3Z5L6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc18b1D3Z5L6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc18b1D3Z5L6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc18b1D3Z5L6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc18b1D3Z5L6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc18b1D3Z5L6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc18b1D3Z5L6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc18b1D3Z5L6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc18b1D3Z5L6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc18b1D3Z5L6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc18b1D3Z5L6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc18b1D3Z5L6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc18b1D3Z5L6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc18b1D3Z5L6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms