Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim12cD3Z3L3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms