Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700015F17RikD3YUK8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700015F17RikD3YUK8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700015F17RikD3YUK8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms