Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprbB2RU80 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms