Protein–RNA interactions for Protein: B1AWC9

Pde4b, Phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4bB1AWC9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde4bB1AWC9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde4bB1AWC9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde4bB1AWC9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde4bB1AWC9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde4bB1AWC9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde4bB1AWC9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde4bB1AWC9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde4bB1AWC9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde4bB1AWC9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde4bB1AWC9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde4bB1AWC9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde4bB1AWC9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms