Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Herc3A6H6S0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Herc3A6H6S0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms