Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms