Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdr2lA2A6T1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.3 ms