Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trbv30A0A0B4J1P1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv30A0A0B4J1P1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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