Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H8

Igkv1-133, Immunoglobulin kappa variable 1-133 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms