Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
1700019A02RikA0A087WPV9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
1700019A02RikA0A087WPV9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
1700019A02RikA0A087WPV9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms