Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5U7

Ighv1-22, Immunoglobulin heavy variable 1-22 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-22A0A075B5U7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ighv1-22A0A075B5U7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms