Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsc22d3Q9Z2S7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms