Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubl3Q9Z2M6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubl3Q9Z2M6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl3Q9Z2M6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms