Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Shcbp1Q9Z179 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Shcbp1Q9Z179 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms