Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rspo1Q9Z132 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rspo1Q9Z132 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms