Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpv2Q9WTR1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpv2Q9WTR1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpv2Q9WTR1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms