Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lhx6Q9R1R0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lhx6Q9R1R0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 415.4 ms