Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc3Q9QZC1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc3Q9QZC1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1026.4 ms