Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUP5

Hapln1, Hyaluronan and proteoglycan link protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln1Q9QUP5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln1Q9QUP5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hapln1Q9QUP5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hapln1Q9QUP5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms