Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclk1Q9JLM8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk1Q9JLM8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dclk1Q9JLM8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms