Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl28Q9JIL2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl28Q9JIL2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl28Q9JIL2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms