Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

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Length 1,160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aff4Q9ESC8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aff4Q9ESC8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aff4Q9ESC8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aff4Q9ESC8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Aff4Q9ESC8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Aff4Q9ESC8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Aff4Q9ESC8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aff4Q9ESC8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Aff4Q9ESC8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Aff4Q9ESC8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Aff4Q9ESC8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Aff4Q9ESC8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms