Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfcp2Q9ERA0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tfcp2Q9ERA0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfcp2Q9ERA0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms